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Werner Gruber ist wissenschaftlicher Mitarbeiter am Institut für Experimentalphysik an der Universität Wien und Lehrbeauftragter. Seit 2013 leitet er die astronomischen Einrichtungen der Wiener Volkshochschulen.
Gruber ist Gründungsmitglied der Sciencebuster, die seit 2007 im deutssprachigen Raum sowie im Fernsehen zu erleben sind.
Er ist Autor verschiedener Bücher.